东晋南朝庐江何氏家学与家风述论

东晋南朝庐江何氏家族是安徽地域境内传统文化世家，在注重文化传家的成长道路上，形成了具有自身品格的家学与家风。庐江何氏家学实践以佛教文化、玄学、儒学为主要内容，不同时期各有侧重，终呈现综合交融的趋势，其家学之影响在与主流文化的互动中得以彰显。庐江何氏家风以“清身洁己”为外在特征，在长期的家学实践中不断丰富自身内涵，何氏家风为其文化型士族成长、争取社会政治利益起到了重要的潜在作用。     

甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征，通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子，分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列；这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域；系统发育进化树将该家族成员聚为4大类；共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性，而且在各自染色体组内也存在串联重复事件；基因表达分析发现，大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达，并且在根中表达的基因多于叶片，受到盐胁迫处理时，大部分基因表达量会增加。初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能，为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础，为油菜抗性育种工作提供科学依据。     

玉米XYLPs基因家族表达模式及其蛋白结构分析

通过生物信息学的方法对玉米木质形成素类阿拉伯半乳糖蛋白(xylogen-like arabinogalactan proteins,XYLPs)基因家族的表达模式和蛋白结构进行了分析。ZmXYLPs基因家族成员在染色体上的分布具有一定的偏好性。基因复制事件不仅在基因家族成员数量的扩张和进化中发挥重要作用,同时还可能引起基因表达部位的扩张。根据ZmXYLPs蛋白结构特点,可将其分为两大类。其中仅ZmXYLP10/13/14蛋白存在N连接的糖修饰位点,其余ZmXYLPs蛋白均为O连接糖修饰位点。结果显示,玉米ZmXYLPs的生物学功能可能与其糖基侧链有关,并且其作用并不局限于维管组织发生过程,可能也参与生殖发育过程。     

Should only females of giant freshwater prawn Macrobrachium rosenbergii be selected in genetic improvement programmes?

Sexual dimorphism is widely observed in almost all farmed aquatic animal species but giant freshwater pawn (GFP) is unique, with males characterized by three main morphotypes (blue claw, orange claw and small males) and females by different reproduction status (ovary, berried egg and already‐spawned females). There has been reported evidence that the effect of male morphotype may have masked genetic variation in growth‐related traits, as a result the heritability for male body weight was lower than that estimated in female. A pending question has arisen whether selection should be made in female only. To answer this question, we used an 8‐year data set from a long‐term selection programme (2008–2015) for high growth in this species comprising 106,756 individuals that were offspring of 515 sires and 810 dams. The body weight data of female and male GFP or of each morphotype was treated as a separate trait and a multi‐trait approach was used to estimate genetic correlations for homologous traits between sexes and between morphotypes. Our analysis showed that there were little differences in the heritability estimates between female and male. In female, mature ovary individual displayed higher heritability than berried egg and already‐spawned females. For male, the heritability for blue claw, orange claw and small males were 0.11, 0.06 and 0.00 respectively. Between‐sex genetic correlation was moderate (0.55 ± 0.11) for body weight, suggesting that the trait expressions in female and male may be genetically different. In female, the genetic correlations for body weight among three female types were close to one (0.91–0.94). In contrast, the genetic correlations for body weight between male morphotypes especially between blue claw or orange claw and small males were low (0.15–0.25). Furthermore, we estimated genetic gain as the difference in least square means (LSM) or estimated breeding values (EBV) between the selection line and control group. The genetic gain in body weight was smaller in females than in males. It is concluded that there is no need to run separate breeding programme for female and male GFP. A combined selection using both female and male data can achieve selection response for body weight as demonstrated in the present study.     

辣椒HD-Zip基因家族鉴定、系统进化及表达分析

【目的】鉴定辣椒HD-Zip基因家族,并利用生物信息学方法系统分析其在基因组中的分布、基因结构、进化分化特征及在不同组织中的时空表达特异性,解析该家族的进化特征及生物学功能。【方法】根据已报道及PlantTFDB数据库中的拟南芥HD-Zip序列,利用本地BLAST工具在我国辣椒测序品种‘遵辣1号’基因组中比对,并利用Pfam、SMART工具进一步验证。采用EMBOSS Programs、MEGA、GSDS、MEME、MCScanX、OrthoMCL、Circos等软件预测辣椒HD-Zip基因家族成员蛋白理化性质,构建系统进化树,定位染色体,分析基因结构、基因复制类型及直系、旁系同源基因。基于GEO数据库,运用R软件、本地perl语言及Cytoscape分析辣椒HD-Zip组织表达差异并绘制共表达网络。【结果】本研究在‘遵辣1号’基因组中鉴定获得42条辣椒HD-Zip,命名为CaHDZ01—CaHDZ42。CaHDZs长度跨度较大,70% CaHDZ蛋白的pI小于7.0。除CaHDZ42,其余基因不均匀地分布在12条染色体上,部分基因为片段复制。该基因家族可分为4个亚族,分别含有18、9、5、10个HD-Zip,基因结构及蛋白结构域差别显著。辣椒、番茄和拟南芥3个物种中的直系同源基因对数目大体相同,但同为茄科的辣椒和番茄之间的稍多;辣椒中的旁系同源基因少于番茄和拟南芥,说明辣椒基因组的倍增事件并没有使CaHDZs明显扩增。对无油樟、水稻、玉米、番茄、马铃薯、辣椒‘CM334’、辣椒‘Zunla-1’、毛果杨、葡萄以及拟南芥9个代表物种的HD-Zip进化特征分析结果表明,从被子植物开始,HD-Zip基因家族就稳定存在4个亚族。推测在形成4个亚族前,HD-Zip分为两组,其中一组分化成I和II亚族,而另一组则分化成为III和IV亚族。CaHDZs在根、茎、叶、花芽、花和果实不同发育时期的表达模式分析结果显示,4个亚族具有不同程度的表达趋势。其中I亚族基因在辣椒不同组织中的表达量均较高,且不同成员间表达模式不同,CaHDZ22在茎中的表达最高,表明该基因可能对辣椒茎的生长有重要作用。II、III和IV亚族基因在不同组织中的表达量相对较低,但部分基因在特定组织中具有较大的表达量。如CaHDZ34在辣椒果实成熟后期具有较大高的表达量,CaHDZ02和CaHDZ28在果实膨大时表达较高,CaHDZ04在果实成熟前期具有较高的表达量。CaHDZs表达网络中有33对基因表达趋势的相关系数（PCC）大于0.8,6对大于0.9,表明CaHDZs协同调控了辣椒的生长发育,不同亚族之间也具有协同性。【结论】在‘遵辣1号’基因组中鉴定获得42条CaHDZs,可分为4个亚族,不同亚族的基因结构、蛋白保守结构域及表达模式不同。在进化过程中,辣椒HD-Zip保守性高,数目没有明显扩增,I和II亚族、III和IV亚族关系更近。CaHDZs具有组织表达差异性,协同调控了辣椒的生长发育。     

基于微卫星亲权鉴定技术的短蛸性选择研究

为研究短蛸(Octopus ocellatus)的性选择行为，本研究利用14个多态性微卫星标记，对3个母本、176个子代及17个候选父本进行亲权鉴定，对3个家系中有子代和无子代雄蛸、子代比例高和子代比例低的雄蛸的各形态参数进行t检验，并对子代比例高和子代比例低的父本与母本的遗传相似性与遗传距离进行分析。结果显示，短蛸为多雌多雄的交配模式，为真正意义的雌性混交动物；雄蛸有无子代与其形态参数无相关性；子代比例与父本的形态大小参数无关，而与父母本的遗传相似性和遗传距离有关，父母本遗传相似性越高，遗传距离越小，后代比例越高。本研究为揭示短蛸交配前后的性选择机制提供了重要线索，也为海洋头足类动物的性选择机制研究提供了基础资料。     

Selecting the hologenome to breed for an improved feed efficiency in pigs—A novel selection index

Most traits in animal breeding, including feed efficiency traits in pigs, are affected by many genes with small effect and have a moderately high heritability between 0.1 and 0.5, which enables efficient selection. Since the microbiota composition in the gastrointestinal tract is also partly heritable and was shown to have a substantial effect on feed efficiency, the host genes affect the phenotype not only directly by altering metabolic pathways, but also indirectly by changing the microbiota composition. The effect of the microbiota composition on the breeding value of an animal is the conditional expectation of its breeding value, given the vector with microbiota frequencies, that is The breeding value of an animal can therefore be decomposed into a heritable contribution that arises from an altered microbiota composition and a heritable contribution that arises from altered metabolic pathways within the animal, so Instead of selecting for breeding value , an index comprising the two components and with appropriate weights, that is , can be used. The present study shows how this breeding strategy can be applied in pig genomic selection breeding scheme for two feed efficiency traits and daily gain.     

不同春小麦品种耐低磷性评价及种质筛选

筛选磷高效作物是充分利用土壤磷素和减少磷肥施用量的重要手段。本研究以162份春小麦种质资源为材料,对其苗期的株高、总根长、根表面积等8个指标的耐低磷系数进行分析,采用隶属函数法综合评价春小麦苗期的耐低磷特性,初步筛选耐低磷材料,并进一步进行成株期的耐低磷特性鉴定,筛选出耐低磷材料和磷敏感材料,分析其在低磷下酸性磷酸酶的活性变化。结果表明,低磷胁迫下春小麦材料苗期和成株期的各性状均受到不同程度的影响,并随着胁迫程度的增加,小麦生长受抑制程度增强。通过主成分分析将苗期8个指标转化成4个综合指标(累计贡献率为82.60%),将成株期的10个指标转化为3个综合指标(累计贡献率为83.23%);采用隶属函数法计算耐低磷综合评价值(D)值,对D值进行聚类分析,将苗期的162份春小麦种质资源划分为耐低磷型(10份)、较耐低磷型(26份)、低磷较敏感型(91份)、低磷敏感型(35份)4类。选取耐低磷型材料(5份)和低磷敏感型材料(4份),进一步进行成株期鉴定,最终筛选1份耐低磷材料wp-35和1份磷敏感材料wp-119。通过分析其酸性磷酸酶活性,发现在低磷胁迫下春小麦根系和叶片中的酸性磷酸酶活性均升高,且耐低磷材料的酸性磷酸酶活性高于磷敏感材料。本研究结果可为解析春小麦耐低磷特性、培育耐低磷品种提供种质资源和理论依据。     

基于宗族文化视角的徽州传统村落景观研究

在徽州历史上，宗族不断繁衍壮大，宗族文化深入人心，徽州传统村落景观的形成和发展与此有着密切的关联，尤其是村内的宗族建筑、村落格局、街巷空间、建筑空间等都受此影响。在宗族文化视角下，村落景观提升面临着物质载体受损、传统文化消亡等现实困境。应坚持整体性与原真性、动态性与持续性原则，注重宗族文化资源在空间层次、物质形态、非物质文化等方面的有机转化，最终实现传统村落景观的有机提升。     

土地规模化经营能否促进农业社会化服务获取?——基于全国3类农户样本的实证分析

土地流转和农业社会化服务是经营规模化和服务规模化的根本途径,研究二者关系对农业供给侧结构性改革、农业现代化发展乃至乡村振兴具有重要意义。基于第二期"全国新型农业经营主体发展指数调查"数据,运用负二项回归模型实证分析土地流转及转入不同特征土地对普通农户、专业大户和家庭农场农业社会化服务获取的影响。结果表明,单纯的土地转入对不同类型农户农业社会化服务获取均不具有显著影响。但如果转入土地有利于规模化经营、农业基础设施较好,则能显著促进社会化服务获取。另外,农户经营能力越强,对不同类型社会化服务的应用程度也越高。因此,政府应推动更有效率的土地流转,实现农业适度规模经营;加强农业社会化服务供给,提升农户生产经营效率;强化经营主体培训,增强联结带动能力。